I 1774 blev Bygdoszcz-kanalen, som forbinder floderne Brda, Wisla, Notec og Warta med hinanden, indviet og byen blev centrum for handel med korn. På den tid var Bygdoszcz tysk, og den blev ikke polsk igen før 1920. I 1939 indtager tyskerne på ny byen.
Bydgoszcz har i dag en hurtigt voksende industri, og hovedindtægter til byen kommer hovedsagligt fra fødevare-, elektronik-, kemikalie-, gummi-, træ- og papirindustrien.